El Servicio de Farmacología Clínica, procede del Servicio del Hospital Clínico Moreno de Mora, adscrito a la Facultad de Medicina de Cádiz, se trasladó la plantilla íntegra de ese hospital al Hospital Universitario de Puerto Real en su apertura en abril de 1990.
Desde 1990 ha funcionado como Servicio independiente con actividad asistencial, docente e investigador y desde el 2010 se creó la Unidad de Gestión Clínica.